經(jīng)過(guò)多年的發(fā)展，新疆棉花產(chǎn)業(yè)總體呈現(xiàn)出喜人且驕人的成效，總產(chǎn)、單產(chǎn)、調(diào)出量、農(nóng)民貢獻(xiàn)率等指標(biāo)從1993年開始連續(xù)19年全國(guó)第一。然而，目前新疆棉花產(chǎn)業(yè)存在的問(wèn)題及隱憂必須引起重視。
一是加工能力過(guò)剩，競(jìng)爭(zhēng)無(wú)序。截至2012年底，新疆已取得棉花加工質(zhì)量保證能力證書的棉花加工企業(yè)共有864家、1161條生產(chǎn)線，加工能力超過(guò)600萬(wàn)噸。按照國(guó)家棉花質(zhì)量檢驗(yàn)體制改革的要求，僅需500多家，加工能力嚴(yán)重過(guò)剩，導(dǎo)致重復(fù)建設(shè)、浪費(fèi)資源，企業(yè)吃不飽、惡性競(jìng)爭(zhēng)、忽視棉花質(zhì)量，特別是近年來(lái)混等混級(jí)收購(gòu)加工棉花較普遍，棉花中混入異性纖維的現(xiàn)象有所抬頭。
二是成本高，國(guó)內(nèi)外棉花巨大差價(jià)將會(huì)影響新疆棉花產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。國(guó)外棉花享受本國(guó)高補(bǔ)貼政策，棉花一直處于競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì)。國(guó)棉價(jià)格補(bǔ)貼機(jī)制尚未健全成熟，棉花種植成本高，國(guó)棉與進(jìn)口棉差價(jià)大，無(wú)奈只能靠國(guó)家買單，此問(wèn)題必須認(rèn)真解決，否則將影響棉花產(chǎn)業(yè)發(fā)展大局。
三是新疆棉花經(jīng)營(yíng)長(zhǎng)期處于低層次非高效的階段。新疆棉花市場(chǎng)銷售結(jié)構(gòu)較差，銷售方式長(zhǎng)期以一賣一買的現(xiàn)貨交易為主，由于棉花企業(yè)基本依靠農(nóng)發(fā)行貸款，政策規(guī)定不得進(jìn)入期貨市場(chǎng)，導(dǎo)致新疆進(jìn)入期貨撮合市場(chǎng)經(jīng)營(yíng)比例太低，產(chǎn)銷經(jīng)營(yíng)效益不高。
四是產(chǎn)業(yè)鏈下游對(duì)新疆棉需求弱化，本地棉紡業(yè)對(duì)棉花的需要減弱。內(nèi)地紡織企業(yè)大量使用低價(jià)進(jìn)口棉，對(duì)新疆棉使用量進(jìn)一步降低。很多新建或遷移來(lái)疆的紡織企業(yè)大部分競(jìng)爭(zhēng)力不強(qiáng)，使用新疆棉的廠家不多，致使新疆棉本地銷售弱化。
五是農(nóng)民靠棉花取得的收入遠(yuǎn)小于其他產(chǎn)業(yè)收入。新疆一些地區(qū)的農(nóng)民種植林果或飼養(yǎng)家畜等收入翻番，棉花種植成本較高，尤其是2002年種植長(zhǎng)絨棉的棉農(nóng)，幾乎無(wú)一幸免棉價(jià)下跌造成的損失，收益低，對(duì)棉農(nóng)傷害很大。
六是棉花倉(cāng)儲(chǔ)設(shè)施、設(shè)備亟待改造和建設(shè)。新疆總體上已有的棉花倉(cāng)儲(chǔ)設(shè)施已具規(guī)模，庫(kù)區(qū)、庫(kù)房、鐵路專線基本滿足需要。但隨著我區(qū)棉花產(chǎn)業(yè)的發(fā)展，現(xiàn)有的棉花中轉(zhuǎn)儲(chǔ)備庫(kù)不少由于建庫(kù)時(shí)間久遠(yuǎn)，倉(cāng)儲(chǔ)設(shè)施、設(shè)備老化現(xiàn)象嚴(yán)重，機(jī)械化、電子化水平低，尤其是近3年我區(qū)承擔(dān)代儲(chǔ)任務(wù)后，倉(cāng)容和中轉(zhuǎn)儲(chǔ)備能力不足的矛盾更加突出，需進(jìn)一步加大改造升級(jí)力度。
七是鐵路運(yùn)輸繼續(xù)成為制約新疆棉花經(jīng)營(yíng)的瓶頸。鐵路發(fā)運(yùn)困難多年來(lái)一直是影響新疆棉花銷售的制約因素，由于蘭新鐵路雙復(fù)線及電氣化改造，進(jìn)出新疆商品物資運(yùn)量嚴(yán)重失衡等原因，新疆棉花外運(yùn)持續(xù)緊張，部分內(nèi)地企業(yè)購(gòu)買新疆棉2～4個(gè)月仍難運(yùn)出，占?jí)好藁ㄙ?gòu)銷資金，影響新疆棉外銷及聲譽(yù)。
八是棉花補(bǔ)貼政策力度不大。當(dāng)前國(guó)家對(duì)棉花的補(bǔ)貼政策有良種補(bǔ)貼、運(yùn)費(fèi)補(bǔ)貼、臨時(shí)收儲(chǔ)政策，對(duì)棉農(nóng)、流通企業(yè)及其他直補(bǔ)政策尚未出臺(tái)，更沒(méi)形成長(zhǎng)效機(jī)制。
